Theo thông tin từ Game Freak và The Pokemon Company, Pokemon Legends: Z-A lấy bối cảnh tại thành phố Lumiose, thành phố lớn nhất vùng Kalos với biểu tượng tháp Prism nổi tiếng. Điểm đặc biệt là Lumiose đang trải qua quá trình tái phát triển đô thị công nghệ cao, với mục tiêu trở thành không gian sống chung lý tưởng cho cả con người và Pokemon.
Khi đến Lumiose để tham quan, người chơi sẽ gặp ba Pokemon, và một trong số đó sẽ trở thành đồng hành đầu tiên: Chikorita, Tepig hoặc Totodile. Người chơi sẽ lựa chọn một trong ba Pokemon này để bắt đầu hành trình khám phá thành phố Lumiose cùng cư dân nơi đây.
Tại Lumiose, người chơi sẽ gặp gỡ người bạn mới là Urbane hoặc Tawny. Khách sạn nơi người chơi lưu trú do AZ điều hành, cùng với đối tác Floette của ông. Quá trình tái phát triển Lumiose được quản lý bởi công ty Quizartico Inc, với CEO Jet và thư ký Vinny là những nhân vật quan trọng mà người chơi sẽ tiếp xúc.
Điểm đặc biệt của thành phố Lumiose là các Khu Hoang Dã (Wild Zone), nơi sinh sống tự nhiên của Pokemon hoang dã. Để bắt Pokemon, người chơi cần ngắm cẩn thận trước khi ném Poke Ball. Nếu gặp khó khăn, người chơi có thể sử dụng Pokemon của mình để làm suy yếu mục tiêu, giúp việc bắt Pokemon dễ dàng hơn.
Pokemon Legends: Z-A giới thiệu hệ thống chiến đấu hoàn toàn mới so với các tựa game trước đây. Các đòn tấn công có phạm vi và khu vực ảnh hưởng khác nhau, đòi hỏi người chơi phải lựa chọn đúng thời điểm và vị trí chiến lược. Người chơi sẽ dẫn dắt Pokemon của mình trong trận đấu, né tránh đòn tấn công và thay đổi Pokemon khi cần thiết để tìm thời cơ phản công.
Đặc biệt, một số Pokemon có thể trải qua quá trình Mega Evolution, vượt qua giới hạn tiến hóa thông thường. Khi keystone của người huấn luyện cộng hưởng với Mega Stone của Pokemon, không chỉ hình dạng mà sức mạnh của Pokemon cũng sẽ đạt đến cấp độ mới, giúp xoay chuyển tình thế trận đấu.
